萬年齋山遺址于1982年文物普查時(shí)發(fā)現(xiàn)，為商早期商文化遺址。1983年江西省考古所對(duì)該遺址進(jìn)行了試掘，出土采集文物千余件，主要有生產(chǎn)工具和生活用器兩大類。2005年，萬年文物局在該遺址出土的器物上還發(fā)現(xiàn)了3600多年前的人類指紋。

該遺址的發(fā)現(xiàn)，為萬年類型商文化早期階段斷代提供了新資料，為江西龍山段材料中，進(jìn)一步劃分二里崗期到夏代這一期間的資料提供了線索。